Sa gouvernance est assurée par un conseil d’administration indépendant de l’entreprise fondatrice (Laboratoires Genévrier), dirigé par un groupe multidisciplinaire et pluriprofessionnel d’experts.
Les programmes de SOPHIA sont systématiquement conçus et réalisés en coopération avec les organismes professionnels compétents (Conseils Nationaux Professionnels, fédérations d’associations de formation, sociétés savantes, ect.).